试管连续两次染色体异常最大的可能是父母方面的问题，其中一个是患有遗传疾病，也有可能是母亲年龄比较大，母体患有基础疾病，男方患有精子方面的疾病，父亲精子质量差，如DNA碎片率高也会出现这种情况，还有一种可能性是环境因素，例如环境毒素暴露、长期处于辐射中等，均可能影响胚胎染色体稳定。
三代试管婴儿，也称为PGD/PGS，即胚胎植入前遗传学诊断/筛查，数据显示三代试管可以筛查的遗传疾病有很多，如果连续两次送检胚胎进行筛查，结果均为染色体异常的情况，可能由多种因素导致，具体如下：
1、遗传因素：如果父母之一或双方携带染色体结构异常或平衡易位，这可能增加产生异常胚胎的概率，即使父母表型正常，遗传物质的细微异常也可能传递给下一代。
2、年龄因素：随着年龄增长，女性卵子在减数分裂过程中更易发生错误，导致染色体非整倍体增加，从而影响胚胎的染色体完整性。
3、精子质量：男性精子质量不佳，包括DNA碎片率高，也可导致胚胎染色体异常。
4、母体因素：母体的内分泌环境、免疫状态、慢性疾病或某些药物的使用可能间接影响胚胎的染色体稳定性。
5、环境因素：长期暴露于有害环境因素，如辐射、化学物质等，可能影响配子的质量，进而影响胚胎染色体的正常分裂和发育。
面对连续两次PGS筛查结果异常的情况，建议夫妻双方与医生深入沟通，进行更加全面的遗传咨询和身体检查，必要情况下可以进一步的遗传学测试，以找出染色体异常的原因，如果多次筛查无法获得健康胚胎，可以考虑使用捐赠卵子、精子等其他辅助生育手段以提高试管怀孕的几率。
