水解奶粉只适用于有功能性胃肠病或乳蛋白过敏的宝宝。宝宝长期吃水解小分子蛋白，会对宝宝的肠道消化系统造成影响，还会影响免疫系统的正常发育。所以，即便是有功能性肠胃病、乳蛋白过敏等特殊疾病或医学状况的宝宝，也需要在症状缓解、脱敏后逐渐转至正常的配方奶粉。
水解奶粉比普通奶粉的蛋白质含量高得多，并且水解奶粉比普通奶粉更易于肠道的吸收，也更不容易对宝宝过敏。如果宝宝吃普通的奶粉有过敏或肠胃失衡、偶发性腹泻等情况，可以用水解奶粉来代替普通奶粉。但是长期吃水解奶粉也是有副作用的，比如会影响宝宝肠道消化功能以及影响免疫系统功能等，具体如下：
1、影响宝宝消化功能
水解奶粉中含有一定量的工艺化的酶，宝宝长期喝水解奶粉，容易干扰胃肠道中消化酶的正常生理功能，可能会导致部分宝宝胃肠道消化功能紊乱，影响肠道正常的消化、吸收功能；
2、营养不良风险增大
由于长期喝水解奶粉，消化功能降低后可能会导致部分宝宝摄入的营养物质不能被机体充分地吸收利用，从而使宝宝营养不良的可能性增大，对宝宝正常的生长发育造成危害；
3、影响免疫系统功能
由于水解奶粉中含有的牛奶蛋白的分子相对较小，部分宝宝本身机体免疫力相对较低，不能对较小的牛奶蛋白产生有效的免疫应答反应。因此，长期喝水解奶粉容易影响免疫系统功能，可影响部分宝宝自身免疫力的建立。
宝宝的肠胃功能尚未发育完善，选择奶粉需要更加谨慎，合适的才是最好的。切记水解奶粉不要轻易吃，只有宝宝确诊了牛奶蛋白过敏以后，才需要在医生的指导下食用，且宝宝过敏症状缓解后，也需要循序渐进转为正常的配方奶粉。
