3代试管筛查完胚胎并移植后也有可能会出现胚胎发育不良的情况。因为这一技术并不能完全消除所有可能的遗传因素，此外胚胎的发育不仅仅受到遗传因素的影响，还受到母体环境、内分泌状态、免疫因素、感染等多种因素的影响。这些因素可能导致胚胎无法正常发育或者出现发育迟缓、停育等问题。
虽然说三代试管能筛查的遗传疾病比较多，在筛查完胚胎并移植后，理论上胚胎已经经过了遗传学检测，排除了染色体异常和遗传性疾病的风险，因此，筛查过的胚胎移植后出现发育不良的可能性相对较低，然而一些因素仍可能导致移植后胚胎的发育异常，具体如下：
1、母体环境因素
母体的年龄、体重、激素水平、免疫状态、营养状况等都可能影响胚胎的发育，例如，高龄产妇的卵子质量和数量可能下降，导致胚胎发育不良的风险增加。肥胖和营养不良也可能对胚胎的发育产生负面影响。
2、内分泌因素
母体的内分泌状态对胚胎的发育至关重要，如果说母体存在有甲状腺激素、胰岛素等激素的分泌异常的话就可能导致胚胎无法正常发育。
3、免疫因素
某些免疫疾病，如子宫内膜异位症、自身免疫性疾病等，可能对胚胎产生排斥反应，导致胚胎无法正常着床或者出现发育问题。
4、感染和炎症
母体患有支原体、衣原体、淋球菌等生殖道感染和炎症，可能引起子宫内膜炎和输卵管炎，从而对胚胎的发育造成不良影响，可能会导致胚胎无法正常着床或出现发育问题。
4、生活习惯因素
此外日常的生活中，孕妇有吸烟、饮酒、药物滥用、不健康饮食、缺乏运动等不良生活习惯也可能对胚胎的发育产生负面影响。
尽管经过遗传学筛查的胚胎移植后出现发育不良的风险相对较低，但仍然存在一定的风险，因此，在试管婴儿治疗过程中，医生会全面评估患者的身体状况和生育条件，尽可能地排除可能导致胚胎发育不良的因素，同时，患者在接受治疗期间应保持良好的生活习惯和心态，遵循医生的建议，以最大程度地保障试管婴儿的成功率。
