有卵黄囊但孕中期胎停了最大的原因是胚胎染色体异常。有卵黄囊胎停60%左右是因为胚胎染色体异常造成的，这是最主要原因，基因的生长需要依靠染色体，如果染色体出现问题，胎儿的基因也容易出现异常，会增加胎停的几率。

通常情况下，孕妇年龄越大，胎停的几率越高，就算有卵黄囊但是孕中期还是有可能胎停，孕中期胎停最大的原因就是胚胎染色体异常，除了这方面原因，还有以下几种原因，大家可以做个参考，一定要多加留意。

1.胚胎染色体异常：如果胎儿染色体异常，可能会导致胎儿发育畸形，出现胎儿停育的情况，对怀孕造成严重的影响，需要终止妊娠；

2.环境因素：环境因素也可导致胎停，例如过多接触放射性物质甲醛、射线等，不仅可以导致胎儿畸形，严重者还可造成胎停；

3.黄体功能不全：黄体功能不全可能是孕激素分泌不足导致，可能会导致胎儿发育异常，出现胎儿停育的情况；

4.胚胎质量比较差：精子和卵子的质量比较差的，精子和卵子结合以后也会对胚胎的组织造成影响，出现胎停。

有卵黄囊发生胎停的情况可分为多个阶段，在妊娠任何一个阶段都有胎停的可能性，要保持心情舒畅，禁止剧烈运动，孕妇在怀孕期间不要过度紧张，出现胎停，建议及时就诊，医生会进行针对性处理，有任何不适问题都要及时寻求专业医生帮助。