验孕棒是通过检测尿液中的人绒毛膜促性腺激素(hCG)来判断是否怀孕，而在第三天囊胚着床初期，胚胎释放的hCG水平可能还不足以被验孕棒检测出来，一般一般是在移植后的10天到14hcg值才会逐渐升高，才能被验孕棒测出来是否着床成功。也有可能这个时候的囊胚还没有正式着床发育，进而还不能分泌出人绒毛膜促性腺激素，因此也检测不出来。

在囊胚移植的过程中，第三天胚胎是否成功着床成功通过验孕棒来判断是不正确的，因为验孕棒是通过检测尿液中的hcg值来判断，而才移植三天的囊胚此时可能还没有着床，或者着床后分泌的hcg水平很低，不足以让验孕棒检查出来，除此之外，还有其他因素也会影响检测的结果，具体如下：

1、移植数量：如果进行了多次囊胚移植，那么每次移植的成功率和怀孕的时间都可能不同。因此，在进行验孕时需要考虑移植的数量和时间;

2、母体荷尔蒙水平：母体的荷尔蒙水平也可能会影响囊胚移植后的验孕结果，例如，如果母体体内的黄体酮水平不足，可能会导致受精卵无法成功着床或产生足够的hCG;

3、移植时间：囊胚移植后，通常需要等待约两周左右才能进行验孕，在植入后的早期阶段，验孕棒可能无法检测到HCG，导致测试结果为阴性或者无效;

4、胚胎发育情况：囊胚移植的成功与否与胚胎的质量和发育情况密切相关，如果胚胎无法良好发育或无法在子宫内着床，可能导致HCG的分泌量较低，验孕棒无法测出怀孕;

5、 HCG激素水平：验孕棒的准确性和可靠性与HCG激素水平有关，当HCG激素水平较低，验孕棒可能无法从尿液中检测出来;

6、药物干扰：某些药物可能影响HCG激素的分泌，从而影响验孕棒的准确性。假如含有HCG的药物或促排卵药物在囊胚移植后的短期内使用，可能导致HCG激素水平异常，使测试结果不准确。

综上，囊胚移植后的第三天胚胎是否成功着床无法通过验孕棒直接测出，但可以通过血清hCG检测和定期产检来判断。在这个过程中，夫妇们应保持良好的心态，遵守医生的建议，合理安排休息和饮食，提高胚胎着床的成功率。